针对湖泊污染，吴丰昌建议加强科技攻关，建立水质水生态绩效评估体系，建设国家河湖生态系统监测体系，诊断生态系统健康与稳定性。他同时提出湖泊治理要实现“四个回归”。
河湖底泥（简称“底泥”）是河流和湖泊污染累积及物质交换的中枢，底泥重金属污染是水生态健康的痛点及水环境治理修复的难点。
自20世纪五十年代以来, 由于淡化技术发展、城市用水紧张、河流湖泊污染以及国防军事需求等原因, 海水淡化作为海洋开发的重要组成部分开始兴起。
高原湖泊污染、华北地下水漏斗、居民用水安全、北方水资源短缺等水脏、水少、水安全问题仍未妥善解决。而同时，民众对美好环境的需求日益增长。
从湖泊(水库)水质来看，近年来我国湖泊污染状况有所改善，但总体水环境形势依然严峻，尤其是一些湖库富营养化问题严重。...湖泊及水库水质有所改善，地下水水质整体较差从湖泊(水库)水质来看，经过多年的努力，近年来我国湖泊污染状况有所改善，但总体水环境形势依然严峻，尤其是一些湖库富营养化问题严重。
雨水径流是造成城市非点源污染的主要原因之一，国内外对不同城市雨水径流水质与污染防控进行了大量研究，如美国约有60%的河流和50%的湖泊污染与非点源污染有关；2010年后，北京和上海的城市雨水径流污染占水体污染负荷的比例将分别升至约
所以，治理湖泊污染应当坚持“治湖先治河、治河先治污、治污先治源”的思路，通过入湖河流水质的提升，实现湖泊水环境的持续改善。二是上中下游的关系。...记者在太湖、巢湖、洞庭湖等重要湖泊深入调研后发现，我国湖泊污染治理工作近年来取得积极进展，不过，湖泊治理中权责不清、关系纠葛、牵扯互耗等问题依然没有解决，要从三大关系入手扫除这一湖泊治理中最大的“拦路虎
2.世界知名河流湖泊污染市场化治理措施莱茵河位于欧洲中部，发源于瑞士的阿尔卑斯山中部，流经奥地利、瑞士和法国边界，穿过德国至荷兰入北海。
另一方面，美国环保局把城市地表径流列为导致全美河流和湖泊污染的第三大污染源。
研究数据显示，农业农村面源污染占滇池入湖泊污染总负荷30%~35%。段昌群说。